46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4600 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  99.55 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  90.13 
 
 		 223 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  88.34 
 
 		 223 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  85.2 
 
 		 223 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  79.73 
 
 		 223 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  79.73 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  79.73 
 
 		 223 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  71.17 
 
 		 228 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  75.12 
 
 		 225 aa  333  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  75 
 
 		 228 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  72.99 
 
 		 224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  71.29 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  72.12 
 
 		 227 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  69.16 
 
 		 226 aa  318  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  70.18 
 
 		 224 aa  318  6e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  68.14 
 
 		 226 aa  315  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  65.61 
 
 		 224 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  69.9 
 
 		 225 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  69.76 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  69.76 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  69.95 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  68.78 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  65.14 
 
 		 225 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  65.14 
 
 		 301 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  65.14 
 
 		 301 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  65.14 
 
 		 301 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  65.14 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  65.14 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  64.09 
 
 		 222 aa  293  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  65.74 
 
 		 219 aa  293  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  67.98 
 
 		 207 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  67.49 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  31.17 
 
 		 324 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  33.91 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  38.2 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  37.71 
 
 		 321 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  37.71 
 
 		 321 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  33.91 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  57.58 
 
 		 100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  31.28 
 
 		 337 aa  98.6  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  29.44 
 
 		 321 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  24.74 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  24.09 
 
 		 315 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  24.89 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  25.93 
 
 		 490 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>