56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1195 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  29.06 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  28.79 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  28.68 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  27.53 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  24.85 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  27.48 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  28.52 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  26.26 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  27.72 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  26.01 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  24.77 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  26.78 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  26.78 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  26.78 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  26.81 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  29.49 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  26.81 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  26.81 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  27.19 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  26.72 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  26.72 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  26.72 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  26.36 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  27.65 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  27.65 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  26.56 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  24.07 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  28.57 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  27.6 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  28.18 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  27.73 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  26.87 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  26.78 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  25.44 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  26.25 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  27.73 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  26.78 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  28.79 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  26.52 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  28.64 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  24.77 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  29.51 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  26.79 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2149  hypothetical protein  37.5 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  23.95 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  23.28 
 
 		 223 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  23.28 
 
 		 223 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  26.11 
 
 		 226 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  24.3 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0651  hypothetical protein  23.31 
 
 		 334 aa  45.8  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  23.78 
 
 		 574 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  23.39 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>