50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3786 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  53.44 
 
 		 322 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  47.81 
 
 		 337 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  46.85 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  45.49 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  44.74 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  35.51 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  36.2 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  28.7 
 
 		 222 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  28.88 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  32.71 
 
 		 225 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  27.85 
 
 		 223 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 223 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 223 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  29.44 
 
 		 223 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  30.95 
 
 		 244 aa  92.4  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  32.7 
 
 		 225 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  32.41 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  32.41 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  28.97 
 
 		 223 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  31.94 
 
 		 225 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  28.72 
 
 		 225 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  27.93 
 
 		 223 aa  89  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  31.19 
 
 		 225 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  31.19 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  31.19 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  28.65 
 
 		 226 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  28.57 
 
 		 223 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  31.16 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  31.19 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  31.19 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  31.19 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  30.51 
 
 		 226 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  29.78 
 
 		 228 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  29.78 
 
 		 228 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  33.88 
 
 		 207 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  25.55 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  30.36 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  30.18 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  26.7 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  24.77 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  28.06 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  25.44 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  29.3 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  29.7 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  24.58 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  25.98 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2149  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  25.7 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>