55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2162 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2162  curli production assembly/transport component CsgG  100 
 
 		 327 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  37.22 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  36.77 
 
 		 340 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  32.65 
 
 		 330 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  26.69 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0374  Curli production assembly/transport component CsgG  28.17 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1105  Curli production assembly/transport component CsgG  29.95 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  27.62 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  28.74 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  28.9 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  29.1 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1717  curli production assembly/transport component CsgG  28.5 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000937383  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  23.77 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  29.01 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1518  Curli production assembly/transport component CsgG  30.73 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284024  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1501  hypothetical protein  24.63 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  26.62 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  27.73 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  27.96 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  27.49 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  27.78 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  26.82 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  26.82 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  27.22 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  27.22 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  27.22 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  27.22 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  27.22 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  25.6 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  27.22 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  26.32 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  24.89 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  25.2 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  25.2 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  26.99 
 
 		 224 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  26.98 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  27.22 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  25.41 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  25.41 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2857  curli production assembly/transport component CsgG, putative  26.8 
 
 		 261 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.680035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  26.4 
 
 		 223 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  26.35 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2389  hypothetical protein  22.7 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  26.4 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  25.11 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  25.11 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  25 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0651  hypothetical protein  27.36 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0086  periplasmic protein  23.16 
 
 		 435 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1146  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  25.24 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  23.7 
 
 		 226 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  25.6 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0666  curli production assembly/transport component CsgG  19.6 
 
 		 490 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>