48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3602 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3602  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000103264  hitchhiker  0.0000000418718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0355  hypothetical protein  89.09 
 
 		 330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2798  hypothetical protein  56.71 
 
 		 319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3028  hypothetical protein  46.99 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3202  hypothetical protein  46.53 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.759155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2751  hypothetical protein  46.04 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3733  hypothetical protein  46.53 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2801  hypothetical protein  46.53 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.312341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3704  hypothetical protein  46.53 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1753  hypothetical protein  46.53 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3762  hypothetical protein  46.22 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0291  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0367  hypothetical protein  37.31 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.669573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2719  hypothetical protein  37 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0388  hypothetical protein  37 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.180879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0307  hypothetical protein  37.46 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0316  hypothetical protein  36.62 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  33.89 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  21.95 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  27.93 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  29.51 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  25.66 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  26.11 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  28.42 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  27.27 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  21.57 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  26.04 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  27.87 
 
 		 356 aa  49.3  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  28.04 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  25.14 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  28.89 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.57 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  21.3 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  25.82 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  20.57 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  21.3 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  21.33 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  24.34 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  21.33 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  18.26 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  30.27 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  22.4 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  23.28 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.04 
 
 		 359 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>