38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0355 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0355  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3602  hypothetical protein  89.09 
 
 		 330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000103264  hitchhiker  0.0000000418718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2798  hypothetical protein  56.97 
 
 		 319 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3028  hypothetical protein  47.75 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2751  hypothetical protein  46.04 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2801  hypothetical protein  46.22 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.312341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3704  hypothetical protein  46.22 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1753  hypothetical protein  46.22 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3202  hypothetical protein  46.22 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.759155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3733  hypothetical protein  46.22 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3762  hypothetical protein  45.92 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0291  hypothetical protein  40.13 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0367  hypothetical protein  35.58 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.669573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0388  hypothetical protein  35.58 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.180879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2719  hypothetical protein  35.58 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0307  hypothetical protein  36.86 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0316  hypothetical protein  36.28 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  32.04 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  28.11 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  29.83 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.45 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  25.56 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  25.7 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  28.18 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  28.18 
 
 		 356 aa  49.3  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  26.17 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  25.7 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  24.58 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  27.62 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  27.07 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  28.18 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  25.7 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  24.6 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  21.86 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  26.24 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  24.87 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  24.86 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>