25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3762 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3762  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3733  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2801  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.312341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3704  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1753  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3202  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.759155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2751  hypothetical protein  98.1 
 
 
312 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3028  hypothetical protein  88.29 
 
 
316 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3602  hypothetical protein  47.13 
 
 
330 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000103264  hitchhiker  0.0000000418718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0355  hypothetical protein  46.83 
 
 
330 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2798  hypothetical protein  44.73 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0367  hypothetical protein  40.97 
 
 
307 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.669573  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0388  hypothetical protein  40.32 
 
 
307 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.180879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2719  hypothetical protein  40.32 
 
 
307 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0291  hypothetical protein  44.66 
 
 
307 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0316  hypothetical protein  43.97 
 
 
307 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0307  hypothetical protein  43.65 
 
 
307 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  27.38 
 
 
353 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  26.6 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  26.94 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  26.6 
 
 
361 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  26.94 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  26.6 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  26.8 
 
 
359 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  27.84 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>