58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2798 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2798  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0355  hypothetical protein  56.97 
 
 		 330 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3602  hypothetical protein  56.71 
 
 		 330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000103264  hitchhiker  0.0000000418718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3028  hypothetical protein  43.99 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3202  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.759155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1753  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3704  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3733  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2801  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.312341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3762  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2751  hypothetical protein  42.81 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0367  hypothetical protein  36.69 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.669573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0388  hypothetical protein  36.36 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.180879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2719  hypothetical protein  36.36 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0291  hypothetical protein  39.29 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0316  hypothetical protein  35.99 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0307  hypothetical protein  36.22 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  29.31 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  27.91 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  21.46 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  26.55 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  29.44 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  29.53 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  29.02 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.82 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  29.89 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  29.02 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  27.13 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  26.12 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  27.27 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  26.09 
 
 		 355 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  31.4 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  28.81 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  28.26 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.79 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  21.26 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  28.25 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  25.27 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  28.21 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  25.41 
 
 		 392 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  24.19 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  29.47 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  21.95 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  22.44 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  27.47 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  21.99 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  20.95 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.81 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  22.65 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  29.44 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.66 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.81 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  22.83 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  22.51 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.66 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.43 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  24.08 
 
 		 379 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>