25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3704 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3733  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2801  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.312341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3704  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1753  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3202  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.759155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3762  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2751  hypothetical protein  98.41 
 
 
312 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3028  hypothetical protein  88.61 
 
 
316 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3602  hypothetical protein  47.43 
 
 
330 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000103264  hitchhiker  0.0000000418718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0355  hypothetical protein  47.13 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2798  hypothetical protein  44.73 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0367  hypothetical protein  40.65 
 
 
307 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.669573  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0388  hypothetical protein  40 
 
 
307 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.180879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2719  hypothetical protein  40 
 
 
307 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0291  hypothetical protein  44.34 
 
 
307 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0316  hypothetical protein  43.65 
 
 
307 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0307  hypothetical protein  43.32 
 
 
307 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  27.38 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  26.6 
 
 
361 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  26.94 
 
 
356 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  26.94 
 
 
359 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  26.6 
 
 
361 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  26.6 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  26.8 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  27.84 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>