18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0307 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0307  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0316  hypothetical protein  96.74 
 
 
307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0367  hypothetical protein  75.24 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.669573  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2719  hypothetical protein  74.27 
 
 
307 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0388  hypothetical protein  74.27 
 
 
307 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.180879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0291  hypothetical protein  76.3 
 
 
307 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3028  hypothetical protein  41.69 
 
 
316 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3762  hypothetical protein  43.14 
 
 
315 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2751  hypothetical protein  41.91 
 
 
312 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3733  hypothetical protein  42.81 
 
 
315 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2801  hypothetical protein  42.81 
 
 
315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.312341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3704  hypothetical protein  42.81 
 
 
315 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1753  hypothetical protein  42.81 
 
 
315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3202  hypothetical protein  42.81 
 
 
315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.759155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3602  hypothetical protein  37.46 
 
 
330 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000103264  hitchhiker  0.0000000418718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0355  hypothetical protein  37.01 
 
 
330 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2798  hypothetical protein  37.18 
 
 
319 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3487  hypothetical protein  71.7 
 
 
118 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>