More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0255 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0255  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 154 aa  302  9.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000533555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  46.36 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  48.99 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  42.48 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  42.38 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  40.79 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  42.76 
 
 		 180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  39.6 
 
 		 160 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  43.14 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 158 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  47.58 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>