25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2628 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2628  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1352  extracellular ligand-binding receptor  65.61 
 
 		 432 aa  241  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1235  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1012  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0303063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3322  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 		 423 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 		 379 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 376 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.73 
 
 		 378 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 379 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.06 
 
 		 397 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  36.76 
 
 		 396 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  51.16 
 
 		 394 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 		 379 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 397 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 384 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 379 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.71 
 
 		 380 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 		 379 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 		 379 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  38.78 
 
 		 392 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 408 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 411 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 		 414 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 400 aa  41.6  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 384 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>