More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23540  SSU ribosomal protein S11P  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  85.93 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0653  ribosomal protein S11  85.93 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16910  SSU ribosomal protein S11P  85.07 
 
 		 134 aa  211  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  88.06 
 
 		 134 aa  208  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2619  30S ribosomal protein S11  86.57 
 
 		 134 aa  207  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  81.34 
 
 		 134 aa  206  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  81.34 
 
 		 134 aa  206  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29470  SSU ribosomal protein S11P  86.67 
 
 		 135 aa  205  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0093892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2941  30S ribosomal protein S11  85.82 
 
 		 133 aa  204  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2656  30S ribosomal protein S11  84.33 
 
 		 133 aa  204  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0714  30S ribosomal protein S11  84.44 
 
 		 135 aa  203  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  81.62 
 
 		 136 aa  202  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  80.74 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  86.78 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2627  30S ribosomal protein S11  83.58 
 
 		 133 aa  200  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  80.17 
 
 		 131 aa  200  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  84.25 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  81.75 
 
 		 132 aa  199  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  81.75 
 
 		 132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  83.46 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  77.78 
 
 		 135 aa  197  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  82.22 
 
 		 135 aa  197  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  80 
 
 		 135 aa  196  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  82.81 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3114  ribosomal protein S11  81.48 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  75.91 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0962  ribosomal protein S11  77.94 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  85.37 
 
 		 132 aa  190  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  80.6 
 
 		 134 aa  190  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  78.23 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6585  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 135 aa  184  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  74.26 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20610  SSU ribosomal protein S11P  85.34 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  78.05 
 
 		 138 aa  176  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01430  SSU ribosomal protein S11P  80.17 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.42719  normal  0.725515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  79.34 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000365846  decreased coverage  0.00000000490593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  64 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  63.2 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  63.2 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 137 aa  167  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 130 aa  167  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1135  ribosomal protein S11  72.93 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168888  normal  0.0833424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  67.16 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 131 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 130 aa  166  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  69.29 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  60.32 
 
 		 130 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  57.46 
 
 		 134 aa  163  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  58.21 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2130  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.012863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>