65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3888 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  95.96 
 
 		 99 aa  182  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  90.91 
 
 		 99 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  70.1 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  86.87 
 
 		 99 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  86.87 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  60.44 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  61.63 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  59.14 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  59.14 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  59.78 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  55.34 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  60.24 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  60.24 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  60.24 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  60.24 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  60.24 
 
 		 139 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  54.95 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  54.95 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  55.34 
 
 		 103 aa  103  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  71.83 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  68.66 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  69.07 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  39.81 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  52.05 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  51.39 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  52.05 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  49.3 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  42.86 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  50 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  56.86 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  50.98 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0447  hypothetical protein  44.21 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.687492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  45.95 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  40.79 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  47.06 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  47.06 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  41 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  42.03 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  49.02 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  47.06 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  49.02 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  39.36 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  34.34 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  42.11 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  33.7 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  44.78 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  41.18 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  35.71 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  33.68 
 
 		 469 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  46.03 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  35.8 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  48.08 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2270  putative signal peptide protein  46.48 
 
 		 145 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  35.05 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  38.03 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1354  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  52.38 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0338  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1947  signal peptide protein  52.63 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  0.055164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  35.48 
 
 		 180 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>