61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0588 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  53.64 
 
 		 200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  52.05 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3927  hypothetical protein  49.28 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  46.51 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  46.51 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  38.4 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  39.29 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  36.7 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  41.98 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  38.32 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  49.21 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  40.62 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  34.31 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  40.62 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  36.97 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  44.21 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  44.21 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  44.21 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  44.21 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  43.3 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  33.94 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  43.3 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  43.16 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  41.49 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  45.59 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  40.59 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  40.59 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  45.59 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  31.18 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  45.59 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  32.08 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  46.15 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  46.27 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  40.66 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  39.6 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  39.24 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  34.91 
 
 		 349 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  39.24 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  38.75 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  34.4 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  44.23 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  28.48 
 
 		 275 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  40.38 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  43.28 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  39.73 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  42.31 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0338  hypothetical protein  55.88 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  40.91 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1354  hypothetical protein  55.88 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  42.31 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  37.68 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  46 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  47.17 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  31.73 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  42.11 
 
 		 469 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  38.46 
 
 		 143 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  39.74 
 
 		 72 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>