26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3552 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  258  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  39.51 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  31.71 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  34.68 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  28.93 
 
 		 275 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5026  hypothetical protein  55.26 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531958  normal  0.127918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  37.84 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  29.25 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  29.25 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  52.63 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  30.7 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  31.16 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  37.8 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  30.17 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  32.88 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  43.75 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  37.14 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  32.88 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  32.88 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  32.88 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  30.43 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  31.82 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  31.82 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>