13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1353 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  738    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  56.89 
 
 
479 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0178  hypothetical protein  45.94 
 
 
421 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000132954  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  40.97 
 
 
522 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  48.81 
 
 
469 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  37.63 
 
 
133 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  35.79 
 
 
200 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  34.78 
 
 
180 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  40.35 
 
 
148 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  47.06 
 
 
143 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  34.82 
 
 
129 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  36.84 
 
 
150 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>