50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0722 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  289  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  54.05 
 
 
150 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  39.56 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  36.27 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  50.82 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  45.95 
 
 
197 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  42.19 
 
 
203 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  44.16 
 
 
522 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  37.62 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  37.62 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  37.97 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  43.84 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  37 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  35.37 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  42.11 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  35.37 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  35.37 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  35.37 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  35.37 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  36 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  35 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  35 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  35.37 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  35.37 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  31.96 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  40.28 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  41.1 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  41.1 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  34.15 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  40.35 
 
 
357 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  43.06 
 
 
349 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  42.59 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  39.71 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  40.38 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  35.09 
 
 
469 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  40 
 
 
479 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  35.71 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  40.38 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  35.62 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  36.54 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  36.54 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  36.54 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  35.29 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1391  hypothetical protein  49.28 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>