36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2751 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  949    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  51.16 
 
 
479 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  48.4 
 
 
357 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0178  hypothetical protein  40.93 
 
 
421 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000132954  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.08 
 
 
522 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  41.98 
 
 
133 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  38.57 
 
 
124 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  52 
 
 
143 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  38.57 
 
 
124 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  33.03 
 
 
203 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  41.56 
 
 
103 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  39.39 
 
 
139 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  37.33 
 
 
133 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  37.33 
 
 
133 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  31.13 
 
 
200 aa  47  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  37.14 
 
 
134 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  38.89 
 
 
135 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  48.15 
 
 
113 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.61 
 
 
106 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  41.1 
 
 
99 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  38.57 
 
 
103 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  34.57 
 
 
99 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 
180 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>