49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1243 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  295  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  56.03 
 
 
148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  40.62 
 
 
203 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  32.26 
 
 
200 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  45.9 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  38.96 
 
 
197 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  38.27 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  38.27 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  38.27 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  38.27 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  38.27 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  38.27 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  38.27 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  33.96 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  32.97 
 
 
180 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  37.84 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  32.17 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  34.94 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  36.49 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  36.49 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  36.23 
 
 
522 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  34.09 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  34.34 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  32.14 
 
 
349 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  34.57 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  38.24 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  36.99 
 
 
99 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  40.38 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  34.67 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  34.67 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 
469 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  34.25 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  30.11 
 
 
275 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  27.03 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  36.84 
 
 
357 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  34.25 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  34.26 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  37.14 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  33.33 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  34.55 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  33.68 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  34.62 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  34.21 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>