58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2151 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1947  signal peptide protein  62.4 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  0.055164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  48.84 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2270  putative signal peptide protein  60 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  47.86 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  45.05 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  45.45 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  47.76 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  40.96 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  47.76 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  36.44 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  41.51 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  41.13 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  36.08 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  40.7 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  39.39 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  39.53 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  39.18 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  48.44 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  38.89 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  38.32 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  41.1 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  35.05 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  46.97 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  44.62 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  49.12 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  34.69 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  38.14 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  38.82 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  38.82 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  38.82 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  38.82 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1391  hypothetical protein  46.67 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  38.82 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  37.35 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  38.82 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  47.37 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  63.33 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  30.84 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  35.14 
 
 		 469 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  41.54 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  60.61 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  60.61 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  29.91 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  35.78 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  40.26 
 
 		 357 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  41.18 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  29.91 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  64.71 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  40.38 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>