63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5019 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  100 
 
 
106 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  69.07 
 
 
99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  60.19 
 
 
103 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  61.17 
 
 
103 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  61.17 
 
 
103 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  78.67 
 
 
99 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  78.67 
 
 
99 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  63.75 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  63.75 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  63.75 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  63.75 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  77.78 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  63.75 
 
 
139 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  69.33 
 
 
133 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  77.36 
 
 
112 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  55.21 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  55.21 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  65.82 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  66.67 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  66.67 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  66.67 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  57.89 
 
 
133 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  57.89 
 
 
133 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  69.12 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  69.07 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  67.01 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  47.37 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  47.37 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  39.81 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  50.75 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  50 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  47.89 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  42.16 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  38.32 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  36.89 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  54.9 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  56.86 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  54.9 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0447  hypothetical protein  43.81 
 
 
112 aa  57.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.687492  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  47.3 
 
 
197 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  40.91 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.89 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  33.98 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  34 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  34.02 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  42.11 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  40.79 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  50.94 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  31.96 
 
 
275 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  33.02 
 
 
125 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  37.61 
 
 
469 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  37.7 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  37.97 
 
 
522 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  35.56 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  40.58 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2328  hypothetical protein  36.61 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  40.85 
 
 
72 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0338  hypothetical protein  55.88 
 
 
310 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1354  hypothetical protein  55.88 
 
 
310 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>