58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1205 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  41.22 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  47.06 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  41.58 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  58.21 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  41.58 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  38.54 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  37.96 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  53.03 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  41 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  41.58 
 
 		 99 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  36.44 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  44.19 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  46.97 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  36.44 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  46.97 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  37.25 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  34.34 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  37.25 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  39.25 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  41.25 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  50.79 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  50.88 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  45.45 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  50.88 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.25 
 
 		 125 aa  57  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1947  signal peptide protein  34.88 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  0.055164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2270  putative signal peptide protein  35.16 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  34.31 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  49.06 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  43.94 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  43.08 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  41.67 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  34.69 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  38.03 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  38.03 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  38.03 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  38.57 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  36.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  35.62 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  40.38 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  40.38 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  43.64 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  43.14 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>