43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3171 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  35.48 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  37.97 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  36.25 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  35.42 
 
 		 124 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  38.16 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  38.16 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  38.16 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  38.16 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  38.16 
 
 		 139 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  34.78 
 
 		 357 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  38.16 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  38.16 
 
 		 124 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  31.36 
 
 		 275 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  39.02 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  40.26 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  40.26 
 
 		 286 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  40.26 
 
 		 286 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  44.23 
 
 		 124 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  39.71 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  38.24 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  45.76 
 
 		 479 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  46.15 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  46.15 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  35.29 
 
 		 349 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  40.35 
 
 		 469 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  41.51 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  38.75 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  40.28 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.27 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  34.69 
 
 		 142 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  39.68 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 110 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  51.16 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  35.23 
 
 		 110 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  43.14 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>