55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4502 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  100 
 
 
142 aa  278  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  60.43 
 
 
138 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  57.78 
 
 
138 aa  144  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  52.99 
 
 
129 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  46.38 
 
 
125 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  34.68 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  47.83 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  38.71 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  36.52 
 
 
349 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  49.25 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  38.68 
 
 
200 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  33.6 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  33.6 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  36.52 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  34.31 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  36.22 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  33.07 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  36.59 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  38.52 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  37.7 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  36.59 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  36.36 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  43.94 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  42.42 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  42.42 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  47.06 
 
 
110 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  40.91 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0447  hypothetical protein  49.18 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.687492  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  42.42 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3693  putative signal peptide protein  50.85 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  45.61 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  45.61 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  42.65 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  35.58 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  34.69 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  29.41 
 
 
275 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  35.51 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  44.78 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0141  hypothetical protein  39.29 
 
 
397 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0338  hypothetical protein  54.84 
 
 
310 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0241  hypothetical protein  80 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1354  hypothetical protein  54.84 
 
 
310 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1344  hypothetical protein  85 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0909  hypothetical protein  32.86 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  42.31 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  33.06 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1022  hypothetical protein  35.23 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>