53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2218 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  100 
 
 		 133 aa  268  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  58.04 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  44.04 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  47.29 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  37.7 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2270  putative signal peptide protein  42.19 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1947  signal peptide protein  38.93 
 
 		 145 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  0.055164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  36.89 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  37.5 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  39.81 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  45.83 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  45.24 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  36.46 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  41.98 
 
 		 469 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  48 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  43.42 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  48 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  31.11 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  32.43 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  37.63 
 
 		 357 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  46.77 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  40.24 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  45.33 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  40.24 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  34.02 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  40.24 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  44.78 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  34.48 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  43.28 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  32.32 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  39.02 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  43.84 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  34.55 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  42.47 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  43.28 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  41.79 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  29.13 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  32.61 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0178  hypothetical protein  34.94 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000132954  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  30.71 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  40.3 
 
 		 99 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1022  hypothetical protein  32.38 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  40.3 
 
 		 99 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>