26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0178 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0178  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  835    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000132954  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  49.37 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  44.28 
 
 
357 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  40.61 
 
 
469 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  43.6 
 
 
522 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  34.21 
 
 
139 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0155  hypothetical protein  41.27 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694337  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  34.21 
 
 
124 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  34.21 
 
 
124 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  36.08 
 
 
200 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  53.85 
 
 
113 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  31.48 
 
 
275 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  34.58 
 
 
106 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  36.36 
 
 
150 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  57.89 
 
 
123 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  57.89 
 
 
123 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  46.55 
 
 
143 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  57.89 
 
 
123 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  41.82 
 
 
148 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  32.05 
 
 
139 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  37.31 
 
 
349 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  57.89 
 
 
124 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>