56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3882 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  97.83 
 
 		 138 aa  248  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  61.79 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  52.55 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  60.56 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  47.37 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  37.7 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  52.05 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  53.73 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  52.05 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  52.05 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  34.21 
 
 		 349 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  37.61 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  35.9 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  40.4 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  38.32 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  35.77 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  35.77 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  47.83 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  47.06 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  54.39 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  47.76 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  47.76 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  46.97 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0447  hypothetical protein  42.2 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.687492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  52.63 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  37.96 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  46.15 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  38.04 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  49.06 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  35.58 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  41.1 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  34 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  34.02 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  32.52 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1022  hypothetical protein  37.93 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  32.11 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  38.03 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  43.64 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0338  hypothetical protein  54.84 
 
 		 310 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1354  hypothetical protein  54.84 
 
 		 310 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  31.25 
 
 		 469 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  31.63 
 
 		 180 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3693  putative signal peptide protein  52.27 
 
 		 107 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0241  hypothetical protein  79.17 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>