42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0472 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  28.23 
 
 		 349 aa  78.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  44.58 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  40.74 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  28.5 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  46.48 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.08 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  31.48 
 
 		 469 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  41.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  37.66 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0155  hypothetical protein  24.19 
 
 		 424 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  26.37 
 
 		 275 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  38.1 
 
 		 126 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  30.43 
 
 		 124 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  44.7  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  33.68 
 
 		 479 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3927  hypothetical protein  47.69 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  37.74 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  37.74 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  37.74 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  38.27 
 
 		 106 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>