56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4591 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  97.58 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  87.1 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  87.1 
 
 		 123 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  87.1 
 
 		 123 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  87.1 
 
 		 123 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  72.58 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  69.23 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  51.47 
 
 		 197 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  41.86 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  51.47 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  45.59 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  45.59 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  47.83 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  42.31 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  44.12 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  44.12 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  44.12 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  44.12 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  44.12 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  44.12 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  44.12 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  44.12 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  47.06 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  43.66 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  42.65 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  42.65 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  45.59 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  42.65 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  44.93 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  44.93 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  44.93 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  50.98 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  33.9 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  49.12 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  49.12 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  33.62 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  40.51 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0338  hypothetical protein  56.41 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1354  hypothetical protein  56.41 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  41.43 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  29.77 
 
 		 275 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  39.29 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  44.12 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  35.21 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  31.03 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  43.66 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  41.79 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  41.51 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  46.3 
 
 		 469 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  27.94 
 
 		 132 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  41.67 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0447  hypothetical protein  37.19 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.687492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  43.14 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>