58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0534 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  254  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  52.07 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  55.56 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  55.56 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  62.5 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  44.44 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  54.43 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  41.3 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  41.3 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  41.3 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  42.06 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  38.32 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  37.96 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  41.3 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  40.45 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  35.51 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  48.48 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  41.3 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  43.06 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  43.06 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  37.04 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  45.45 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  37.86 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  38.89 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  41.25 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  41.86 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  36.27 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  41.77 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  46.32 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  40.51 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  42.47 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  42.47 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  34.94 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  43.94 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  34.82 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  46.15 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  35.92 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  34.82 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  44.07 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  40.54 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  45.1 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  45.1 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  45.1 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6087  putative signal peptide protein  66.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  45.1 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  45.1 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  45.1 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  32 
 
 		 469 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  37.18 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  36.47 
 
 		 479 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>