48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5862 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  202  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  61.32 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  39.25 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  52.24 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  38 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  36.63 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  34.26 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  42.71 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  50.82 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  34.91 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  40.74 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  41.57 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  34.31 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  31.68 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  34.31 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  38.55 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  38.55 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  38.55 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  49.25 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  49.25 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  38.55 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  37 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  38.55 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  38.55 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  38.55 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  39.71 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.74 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  37.76 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  41.18 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  40.96 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  49.25 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  40.3 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  35.19 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1947  signal peptide protein  53.33 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  0.055164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  31 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2270  putative signal peptide protein  52.17 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1391  hypothetical protein  45.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  34.78 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  44.23 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  40.74 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  44.78 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  45.76 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  30.25 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  30.25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  48.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  32.14 
 
 		 275 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>