62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1057 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1057  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  201  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  95.15 
 
 
103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  73.79 
 
 
103 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  64.36 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  65.35 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  63.37 
 
 
133 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  61.39 
 
 
133 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  63.11 
 
 
106 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  61.39 
 
 
133 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  61.39 
 
 
133 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  64.52 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  64.52 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  64.52 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  64.52 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  63.44 
 
 
139 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  64.52 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  64.52 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  64.52 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  79.41 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  66.29 
 
 
99 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  58.59 
 
 
99 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  58.59 
 
 
99 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  68.06 
 
 
99 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1630  putative lipoprotein  56.73 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351665  normal  0.134961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4383  hypothetical protein  59.6 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3919  hypothetical protein  60.61 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  35.78 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  44.14 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  42.73 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  42.06 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3155  hypothetical protein  41.76 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.440181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  41.76 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1205  putative signal peptide protein  45.21 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1022  hypothetical protein  44.12 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4127  hypothetical protein  50.98 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5546  hypothetical protein  44.12 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3631  twin-arginine translocation pathway signal  44.12 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4736  hypothetical protein  44.12 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4591  hypothetical protein  50.98 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590785 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3937  hypothetical protein  50.98 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  40.4 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  52.94 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  41.46 
 
 
197 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5381  signal peptide protein  46.15 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.282004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  43.88 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4502  putative signal peptide protein  34.31 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  37.11 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  32.04 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  33.65 
 
 
469 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  35.9 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.35 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  46.77 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0081  hypothetical protein  36.84 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000206374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0447  hypothetical protein  34.82 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.687492  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0338  hypothetical protein  55.88 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1354  hypothetical protein  55.88 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  51.02 
 
 
102 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4790  putative signal peptide protein  33.01 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  35.82 
 
 
479 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  33.33 
 
 
522 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>