15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4375 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3910  hypothetical protein  95.83 
 
 		 72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3894  hypothetical protein  93.06 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4474  hypothetical protein  93.06 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5829  hypothetical protein  93.06 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000848115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1386  hypothetical protein  90.28 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0143082  normal  0.150103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5026  hypothetical protein  73.91 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531958  normal  0.127918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  73.58 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3539  hypothetical protein  56.25 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  39.51 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  37.97 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  32.5 
 
 		 349 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  39.74 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.8 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  39.66 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>