16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5829 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3894  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4474  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944683  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5829  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000848115  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  93.06 
 
 
72 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3910  hypothetical protein  94.44 
 
 
72 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1386  hypothetical protein  93.06 
 
 
86 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0143082  normal  0.150103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5026  hypothetical protein  71.83 
 
 
71 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531958  normal  0.127918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  78 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3539  hypothetical protein  59.38 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  41.25 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  52.38 
 
 
197 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.33 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  43.86 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  41.46 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  36.62 
 
 
103 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>