15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3539 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3539  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  153  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  52.31 
 
 		 72 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5026  hypothetical protein  74.47 
 
 		 71 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531958  normal  0.127918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  66.67 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3894  hypothetical protein  59.38 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4474  hypothetical protein  59.38 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5829  hypothetical protein  59.38 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000848115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3910  hypothetical protein  59.38 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1386  hypothetical protein  69.81 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0143082  normal  0.150103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  41.46 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  40.26 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  42.42 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  38.36 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  39.44 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>