29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4085 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  62.32 
 
 
72 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5026  hypothetical protein  80.85 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531958  normal  0.127918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3539  hypothetical protein  64.71 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3910  hypothetical protein  65.28 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5829  hypothetical protein  62.5 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000848115  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4474  hypothetical protein  62.5 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944683  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3894  hypothetical protein  62.5 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1386  hypothetical protein  62.16 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0143082  normal  0.150103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  39.47 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  42.35 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  41.18 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  38.46 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  30.38 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  34.67 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  53.33 
 
 
103 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  47.37 
 
 
197 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  47.62 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  47.62 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  47.62 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  47.62 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  47.62 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  52.38 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  52.38 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  52.38 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  47.62 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  47.62 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>