22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1386 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1386  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0143082  normal  0.150103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3894  hypothetical protein  93.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4474  hypothetical protein  93.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944683  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5829  hypothetical protein  93.06 
 
 
72 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000848115  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3910  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5026  hypothetical protein  73.24 
 
 
71 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531958  normal  0.127918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  76 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3539  hypothetical protein  56.94 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  39.02 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  36.71 
 
 
197 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  38.1 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 
349 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  37.5 
 
 
103 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  39.71 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  38.6 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  39.71 
 
 
200 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  38.6 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  38.6 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  38.6 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  38.6 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>