50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3767 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2220  hypothetical protein  86.87 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  89.13 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4495  hypothetical protein  78.57 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3870  hypothetical protein  78.57 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0956849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3657  hypothetical protein  78.57 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0854  hypothetical protein  68.32 
 
 		 94 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2549  hypothetical protein  66.34 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0603  hypothetical protein  62.64 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0317  hypothetical protein  66.34 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0351  hypothetical protein  66.34 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1694  hypothetical protein  66.34 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1498  hypothetical protein  66.34 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2406  hypothetical protein  65.35 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5372  hypothetical protein  67.57 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1976  hypothetical protein  63.64 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1609  hypothetical protein  63.64 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0210429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3202  hypothetical protein  63.64 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2495  hypothetical protein  63.64 
 
 		 117 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2112  hypothetical protein  63.64 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2549  hypothetical protein  63.64 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1385  hypothetical protein  63.64 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0245118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2637  hypothetical protein  63.64 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1607  hypothetical protein  74.19 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00747509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2058  putative signal peptide protein  40.43 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2211  putative signal peptide protein  41.05 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4777  hypothetical protein  70.97 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.18704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1606  hypothetical protein  65.79 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133632  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1631  hypothetical protein  44.26 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1151  hypothetical protein  44.26 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0417959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0256  hypothetical protein  71.88 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6990  hypothetical protein  46.05 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2503  hypothetical protein  45.1 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00769616  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1528  hypothetical protein  67.74 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  33.59 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4310  hypothetical protein  37.35 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1634  hypothetical protein  61.29 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101283  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1965  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2095  hypothetical protein  69.23 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1213  hypothetical protein  65.38 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.43875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2726  hypothetical protein  39.24 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00442656  normal  0.0144375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6014  hypothetical protein  67.86 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.810245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2063  hypothetical protein  67.86 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2082  hypothetical protein  67.86 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2315  putative lipoprotein  85 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  39.13 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1385  hypothetical protein  48.19 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0965478  normal  0.615751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2242  putative signal peptide protein  100 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2945  hypothetical protein  40.66 
 
 		 99 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0587422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>