34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1175 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1175  LicD family protein  100 
 
 		 516 aa  1022    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 523 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  31.52 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0820  hypothetical protein  31.46 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1202  LicD family protein  29.45 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673451  normal  0.966221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0746  LicD family protein  26.23 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 253 aa  54.3  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  26.18 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3213  hypothetical protein  31.03 
 
 		 651 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  32.28 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5030  hypothetical protein  46.81 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 223 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  32.86 
 
 		 208 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  28.7 
 
 		 210 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 675 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.61 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  29.84 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 222 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  32.08 
 
 		 256 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 208 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 259 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  28.7 
 
 		 200 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.62 
 
 		 351 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  40.26 
 
 		 246 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 250 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 227 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  47.46 
 
 		 202 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 200 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 		 265 aa  43.9  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  23.96 
 
 		 246 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 211 aa  43.5  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  41.67 
 
 		 208 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>