89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0496 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0496  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
329 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  98.89 
 
 
333 aa  184  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  98.89 
 
 
329 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  88.89 
 
 
328 aa  160  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.33 
 
 
328 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.67 
 
 
328 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.67 
 
 
328 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.67 
 
 
328 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  61.19 
 
 
309 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  56.58 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 
316 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.9 
 
 
328 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.88 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  50.75 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  50.75 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  50.75 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.75 
 
 
305 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
317 aa  67  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.75 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
324 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  42.67 
 
 
305 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.47 
 
 
306 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  47.76 
 
 
303 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.47 
 
 
306 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
326 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.35 
 
 
298 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
301 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
306 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
304 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.53 
 
 
320 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
324 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  44.78 
 
 
308 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
315 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
298 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
311 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
309 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  48.53 
 
 
317 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
306 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
306 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
312 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
303 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  46.77 
 
 
301 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  44 
 
 
301 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 
298 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
305 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
302 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
307 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
290 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
300 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  44.78 
 
 
304 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
436 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0304773  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 
327 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
298 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 
306 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
316 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  45.16 
 
 
318 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 
299 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
312 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
307 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
320 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
310 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.47 
 
 
314 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
298 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
303 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  41.94 
 
 
309 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
303 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
319 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  43.55 
 
 
300 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  40 
 
 
308 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  34.33 
 
 
318 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  38.71 
 
 
309 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  38.71 
 
 
309 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  43.08 
 
 
300 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  38.71 
 
 
309 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  45.16 
 
 
302 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2507  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
326 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
297 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
303 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
304 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
271 aa  40.8  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
289 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
289 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 
320 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
289 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  35.48 
 
 
311 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  38.46 
 
 
306 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>