253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7165 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7165  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  268  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2755  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.57 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.811781  normal  0.919097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1676  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  47.01 
 
 
138 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0508744  hitchhiker  0.000321542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3260  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.36 
 
 
134 aa  103  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0221  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.53 
 
 
135 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.98 
 
 
134 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3850  hypothetical protein  41.73 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2410  hypothetical protein  41.88 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2364  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.16 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.66 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0499  hypothetical protein  38.05 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3388  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3845  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.75 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1907  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.61 
 
 
142 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.39902  hitchhiker  0.0000265119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  36.92 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.15 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  35.66 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.59 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.87 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.03 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.6 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.45 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  35.43 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.9 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.26 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.86 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.07 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0879  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.59 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.62 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0199  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.48 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0030  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.76 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378297  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0383  ATPase  28.35 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.678579  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.57 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72130  hypothetical protein  32.28 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102273  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  30.71 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0063  hypothetical protein  33.62 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.06 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.05 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.11 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  28.33 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.84 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.25 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6263  hypothetical protein  30.71 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  35.2 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.23 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  30.58 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4439  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.35 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.61 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0381  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.15 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.543361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0714  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.92 
 
 
160 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  29.66 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1181  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.43 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128297  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2351  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.4 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08497  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01340)  32.93 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.696938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.17 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0606  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.12 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.2 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2065  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.03 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1034  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.43 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  32.06 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1036  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.48 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.66 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  31.45 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.93 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0334  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.71 
 
 
134 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.81 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0968  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.75 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.4173  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4073  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.5 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.2 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.81 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0715  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.7 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  28 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.4 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1379  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.74 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0258  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.92 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2285  hypothetical protein  29.84 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.16107  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3020  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.6 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.082898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  32.79 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.56 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.726417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.43 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.16 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2610  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.53 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.87 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3017  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.64 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.403214  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.05 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0166  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.56 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.996631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.3 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.21 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.72 
 
 
153 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0848  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0148  hypothetical protein  27.34 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.05 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2637  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.83 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.302583  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2179  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 
153 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.79 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.371874  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3468  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.61 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.53 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.92 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>