291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0713 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  100 
 
 
136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  53.49 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  50.41 
 
 
140 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  48.78 
 
 
132 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  47.46 
 
 
123 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2806  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  49.17 
 
 
131 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.22176  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0879  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.8 
 
 
128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1379  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  44 
 
 
132 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.64 
 
 
132 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.32 
 
 
135 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.35 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1503  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.85 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  40.8 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  37.82 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  38.76 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  36.84 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.68 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0716  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.75 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.07 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.54 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.12 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.36 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1053  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.5 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.81 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0297  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.36 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1035  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.96 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115298  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.5 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2912  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.68 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.96 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.35 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  37.6 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  37.5 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.68 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  38.26 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.26 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.77 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.06 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.96 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.726417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2665  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.38 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0221  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.48 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1036  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.15 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.53 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1483  hypothetical protein  40.82 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.52 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.5 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.89 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  36.8 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  35.54 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1778  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.45 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.52 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.52 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2154  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.07 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.300605  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3882  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.78 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0381  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.84 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.543361  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.52 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.7 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0714  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.33 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.44 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.51 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1928  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.89 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0516617  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2351  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  48.1 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0736  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.62 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4770  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.06 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251226  normal  0.268537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0199  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.54 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.7 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0968  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.49 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.4173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.71 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3850  hypothetical protein  31.5 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2523  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.86 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1181  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.94 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128297  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43799  predicted protein  33.05 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2517  hypothetical protein  33.86 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.29 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4073  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.19 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.88 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.84 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4314  hypothetical protein  28.91 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0631  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.82 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463993  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0063  hypothetical protein  32.79 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1034  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.86 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  40.51 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1553  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.27 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3641  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.37 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.051183  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  30.89 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0030  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.87 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378297  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.9 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0148  hypothetical protein  31.67 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2610  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.89 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0166  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.67 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.996631 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0485  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.71 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231758  normal  0.0484471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2040  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.21 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3196  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.77 
 
 
136 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.52 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.791565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>