237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1778 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1778  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  100 
 
 
140 aa  292  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1053  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  57.04 
 
 
140 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  56.92 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  58.65 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  57.89 
 
 
141 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2912  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  56.49 
 
 
144 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  53.79 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  51.08 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0297  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  53.33 
 
 
137 aa  155  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4363  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  52.67 
 
 
134 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3196  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  52.31 
 
 
134 aa  147  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  52.31 
 
 
134 aa  147  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3882  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  50.38 
 
 
135 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3641  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  48.85 
 
 
135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.051183  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2517  hypothetical protein  46.56 
 
 
138 aa  144  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2523  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.43 
 
 
143 aa  144  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1553  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.67 
 
 
135 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4314  hypothetical protein  46.67 
 
 
162 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0590  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.14 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2618  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.75 
 
 
138 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0942  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.79 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.583327  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0736  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.77 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.55 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1172  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.78 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  38.35 
 
 
145 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.35 
 
 
145 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  39.55 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0485  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.02 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231758  normal  0.0484471 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43799  predicted protein  36.36 
 
 
149 aa  92  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003386  hypothetical protein  40.86 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  34.75 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.83 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0879  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.68 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.05 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1769  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.15 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.868913  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1751  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.15 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591601  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1688  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.15 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.82122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1588  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.15 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1690  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.15 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165527  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.45 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  30.16 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1379  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.45 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2892  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.46 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.7 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0631  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.77 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463993  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2806  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.93 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.22176  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0250  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.58 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.51 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.15 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.01 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.5 
 
 
162 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.01 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.62 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  31.86 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2040  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.54 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  27.64 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.6 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1928  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.1 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0516617  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  26.77 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.85 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1035  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.67 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115298  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4073  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.11 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1483  hypothetical protein  32.58 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1263  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  46.67 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4770  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.61 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251226  normal  0.268537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0716  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.38 
 
 
166 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2154  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.51 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.300605  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  28.1 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3564  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.57 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1872  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.05 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308799  normal  0.266462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1698  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.51 
 
 
133 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1191  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.48 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3017  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.63 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.403214  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.59 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2242  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.46 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.87 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.35 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.78 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.726417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.05 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2315  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.08295  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.04 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.97 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0714  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.34 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.23 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2610  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.06 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  29.13 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.25 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3089  hypothetical protein  33.06 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2604  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.76 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.05 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.25 
 
 
213 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.25 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  34.06 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1036  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.78 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.8 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0424  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155822  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3816  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.06 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496132  normal  0.533485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1034  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.86 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>