248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1263 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1263  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  100 
 
 
138 aa  284  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.94 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  38.35 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.07 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1482  hypothetical protein  34.62 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.59 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  35.88 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2242  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.04 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2410  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  32.81 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0873  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.4 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.287147  normal  0.415185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1053  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  44.74 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2912  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.53 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4363  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  46.05 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  31.54 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1181  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.71 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128297  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.83 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.09 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  31.2 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2351  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.57 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2040  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.86 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.56 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.51 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0606  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1778  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.67 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4371  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.77 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.732633  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2198  hypothetical protein  35.77 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.328863  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2237  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.62 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4073  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.13 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.25 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3017  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.33 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.403214  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0258  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.56 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3022  hypothetical protein  32.17 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.13 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  31.75 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1775  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.34 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.74 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.69 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.84 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.42 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.71 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1034  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.84 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3196  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.42 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.86 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.33 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  34.74 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.03 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.28 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.54 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2315  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.11 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.08295  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2637  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.4 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.302583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.4 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  35.71 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  29.6 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1872  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.41 
 
 
166 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308799  normal  0.266462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3850  hypothetical protein  33.07 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  42.31 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  45.45 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.03 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  45.45 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0383  ATPase  28.8 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.678579  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3388  hypothetical protein  28.46 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0697  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.77 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147302  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.33 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1928  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.5 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0516617  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.13 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.8 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.35 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.31 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.85 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1379  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.2 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.46 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2665  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  39.47 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  39.42 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1172  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.36 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0221  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.5 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  39.42 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.36 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.24 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1483  hypothetical protein  33.57 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2517  hypothetical protein  42.11 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0736  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.7 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0631  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.51 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463993  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2610  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.24 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0032  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.14 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.630723  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43799  predicted protein  42.5 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.726417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0716  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.01 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.23 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0968  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.16 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.4173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.96 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>