265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0383 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0383  ATPase  100 
 
 		 137 aa  290  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.678579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.3 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  33.59 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.93 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.75 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.15 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  36.52 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  31.01 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0221  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.85 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.12 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.25 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.19 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4371  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.78 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.732633  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.78 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  31.2 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.25 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3388  hypothetical protein  24.24 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  26.4 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.56 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3850  hypothetical protein  30.3 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0499  hypothetical protein  34.68 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0381  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.16 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.543361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2351  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.97 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.36 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1676  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.56 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0508744  hitchhiker  0.000321542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.25 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.33 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  29.51 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.36 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.36 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.33 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.08 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3260  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.72 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.25 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  30.25 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.69 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.34 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2364  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.79 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7165  hypothetical protein  28.35 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3020  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.9 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.082898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.27 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.46 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0258  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.36 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  37.76 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2632  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.53 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.8 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.12 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0199  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.98 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1392  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.87 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05260  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3017  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.43 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.403214  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.89 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.48 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.09 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.05 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.97 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1907  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.19 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.39902  hitchhiker  0.0000265119 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0849  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0150  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.14 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6263  hypothetical protein  27.43 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05695  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04120)  33.08 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0063  hypothetical protein  27.07 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3845  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.77 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.42 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72130  hypothetical protein  27.43 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0451  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.78 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  29.92 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0968  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.35 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.4173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0697  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.19 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.78 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1482  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  26.23 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0716  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.98 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0736  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.91 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.2 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.34 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08442  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.895527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.7 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4864  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.97 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.98 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.2 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.95 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.32 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4439  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.55 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1053  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.88 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.77 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0714  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.47 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1483  hypothetical protein  31.67 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0078  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.22 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>