93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2285 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2285  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  344  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.16107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  33.05 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  33.91 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0258  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.87 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.58 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  40.26 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0146992 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10368  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11530)  30.56 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2351  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.03 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.43 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.43 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.92 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0631  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.46 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463993  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.09 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7165  hypothetical protein  29.84 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  27.47 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.27 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0381  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.74 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.543361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  28.33 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.77 
 
 		 130 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.56 
 
 		 135 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.09 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  22.56 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3056  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.79 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00204984  hitchhiker  0.00341554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0916  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.79 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.403663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.68 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.72 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.22 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0221  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.22 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3017  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.81 
 
 		 136 aa  47.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.403214  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3121  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.68 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.540481  normal  0.0305982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1392  hypothetical protein  26.79 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.05 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.22 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.46 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.85 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.2 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  28.24 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.23 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  28.21 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3921  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.76 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3257  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.36 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.2 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.57 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3388  hypothetical protein  25.84 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  24.19 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0849  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.77 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2364  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.43 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.33 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.43 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.19 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.48 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2040  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.77 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1578  hypothetical protein  25.64 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  23.48 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0485  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.97 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231758  normal  0.0484471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1035  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.63 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0199  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.44 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2912  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.31 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2410  hypothetical protein  28 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.09 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.41 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4239  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.63 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.77 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2637  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.65 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.302583  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.91 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.35 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4371  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.84 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.732633  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2665  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.09 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.22 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.91 
 
 		 175 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0706653  normal  0.116642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2154  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.53 
 
 		 138 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.300605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1928  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.91 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0516617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.68 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0716  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.55 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3356  hypothetical protein  35.44 
 
 		 129 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217164  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1700  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.36 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0383  ATPase  28.74 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.678579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.92 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  26.83 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72130  hypothetical protein  32.89 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.84 
 
 		 137 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>