222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3356 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3356  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  270  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217164  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3804  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  57.72 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3856  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  57.72 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0419  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  57.02 
 
 
132 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.820444  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4837  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  54.78 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1419  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  52.14 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.903205  hitchhiker  0.000000225635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1442  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  52.03 
 
 
131 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5046  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  50.85 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4603  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.12 
 
 
123 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3297  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.75 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0635  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.74 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379764  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1191  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.59 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1763  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
149 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0328446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4872  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  39.64 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1513  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
149 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
149 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1823  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
149 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1760  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.119906 
 
 
-
 
NC_004310  BR2040  hypothetical protein  41.38 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288241  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1478  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.52 
 
 
137 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1962  hypothetical protein  41.38 
 
 
135 aa  90.9  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1669  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.64 
 
 
123 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.38 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.54 
 
 
123 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.189147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1218  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
123 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2716  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.98 
 
 
115 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
123 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0648  hypothetical protein  39.81 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2138  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.35 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5593  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.09 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.876476  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9728  predicted protein  36 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4074  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.23 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4109  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.35 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.055952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2692  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.98 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2588  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.11 
 
 
115 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1704  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.24 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.98 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.23 
 
 
115 aa  85.9  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1607  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.74 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2663  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.98 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692714  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1372  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.76 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5355  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.6 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.922702  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3374  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.86 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43250  hypothetical protein  40.35 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.708764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2056  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.240914  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1425  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.51 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.324597  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2807  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.71 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0067  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  39.82 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.84 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2117  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.68 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0449559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06993  hypothetical protein  39.81 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2003  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.51 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4402  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.86 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1576  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.39 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2164  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.96 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.72 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1500  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.84 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.033811  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2565  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.96 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.68 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.857324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5991  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.73 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2158  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0585647  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3305  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0278022  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3630  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.6 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3597  hypothetical protein  38.84 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000951  gfa-like protein  37.61 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.77 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0753  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0256  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920993  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0919  hypothetical protein  38.6 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0084  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.17 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0084  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.84 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3500  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.87 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2693  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2384  hypothetical protein  38.6 
 
 
212 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2465  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0088  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.17 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2699  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.46 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176555  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4268  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.17 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.17 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.46 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383141  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1551  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.55 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2417  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.84 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0741  hypothetical protein  37.72 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0081  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.28 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1238  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.91 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03740  hypothetical protein  39.25 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2168  hypothetical protein  36.04 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.327259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0840  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.04 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5543  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.6 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1706  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.09 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0612  hypothetical protein  44.3 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0922  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.51 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2193  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.86 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.92 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.066667  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03248  hypothetical protein  37.25 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2724  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.85 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1878  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.59 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.1 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0947549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0219  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.33 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.655327  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4549  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.04 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>