145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0919 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0919  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2384  hypothetical protein  99.03 
 
 
212 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0256  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2693  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2465  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0753  hypothetical protein  99.13 
 
 
115 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0741  hypothetical protein  99.13 
 
 
115 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2692  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  60.76 
 
 
156 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5543  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  73.04 
 
 
117 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  71.05 
 
 
115 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2663  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  71.05 
 
 
115 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4109  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  67.54 
 
 
115 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.055952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0635  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  69.3 
 
 
115 aa  177  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379764  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2417  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  68.42 
 
 
115 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0612  hypothetical protein  90.8 
 
 
104 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2588  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  65.22 
 
 
115 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2716  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  65.79 
 
 
115 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5991  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  64.04 
 
 
115 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4074  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  63.16 
 
 
115 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3500  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  63.48 
 
 
115 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5355  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  62.28 
 
 
115 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.922702  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3305  hypothetical protein  63.16 
 
 
115 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0278022  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2699  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  64.91 
 
 
115 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176555  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  59.65 
 
 
115 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383141  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43250  hypothetical protein  58.41 
 
 
115 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.708764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3630  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  58.77 
 
 
115 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2158  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  53.45 
 
 
116 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0585647  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1238  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  53.39 
 
 
118 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2807  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  47.32 
 
 
116 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1704  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  45.95 
 
 
119 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.86 
 
 
115 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2164  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  42.48 
 
 
119 aa  115  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2565  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.36 
 
 
119 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2056  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  49.56 
 
 
116 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.240914  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3235  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  54.26 
 
 
101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3374  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  48.28 
 
 
122 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3297  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.1 
 
 
122 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03740  hypothetical protein  46.22 
 
 
130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4402  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.96 
 
 
119 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4549  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.92 
 
 
118 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357845  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2253  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  45.45 
 
 
117 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.233801  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1191  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  45.38 
 
 
123 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0219  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.38 
 
 
134 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.655327  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4603  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.24 
 
 
123 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1442  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.66 
 
 
131 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.1 
 
 
123 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.189147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1669  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.74 
 
 
123 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1218  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.1 
 
 
123 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.1 
 
 
123 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1607  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.35 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363316  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3856  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.18 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3804  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.18 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.35 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4872  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.23 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3356  hypothetical protein  38.6 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217164  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0248  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.93 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.286799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0419  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.94 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.820444  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5593  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.66 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.876476  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1550  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.29 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0199849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.82 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2724  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.78 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.04 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4837  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.93 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1372  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.96 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2193  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.59 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1419  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.36 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.903205  hitchhiker  0.000000225635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.59 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0947549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1500  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.29 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.033811  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5046  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.04 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000951  gfa-like protein  31.4 
 
 
131 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06993  hypothetical protein  33.01 
 
 
131 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1706  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.03 
 
 
130 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2821  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.74 
 
 
118 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2117  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.14 
 
 
141 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0449559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1576  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.03 
 
 
134 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0922  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.96 
 
 
134 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.32 
 
 
128 aa  58.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.066667  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0088  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.35 
 
 
131 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2040  hypothetical protein  33 
 
 
144 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3597  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0084  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.19 
 
 
131 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3456  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.97 
 
 
110 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2138  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.63 
 
 
141 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1962  hypothetical protein  33 
 
 
135 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1551  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.56 
 
 
147 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0648  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.35 
 
 
131 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0084  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.35 
 
 
131 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0067  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.31 
 
 
131 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2003  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.31 
 
 
141 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.07 
 
 
145 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.857324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4268  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.28 
 
 
131 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2241  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.17 
 
 
133 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451684  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.28 
 
 
131 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03248  hypothetical protein  31.43 
 
 
145 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4277  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31 
 
 
146 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0081  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.28 
 
 
131 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.48 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.52 
 
 
134 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>