128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1238 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1238  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  100 
 
 
118 aa  248  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2957  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  52.99 
 
 
115 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383141  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2699  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  52.14 
 
 
115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176555  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0919  hypothetical protein  53.39 
 
 
207 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2384  hypothetical protein  53.39 
 
 
212 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0753  hypothetical protein  53.39 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0256  hypothetical protein  53.39 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2693  hypothetical protein  53.39 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2465  hypothetical protein  53.39 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5543  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  51.3 
 
 
117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4074  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  51.3 
 
 
115 aa  126  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4109  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  49.57 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.055952  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0741  hypothetical protein  52.54 
 
 
115 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2692  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  50.43 
 
 
156 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2052  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  50.43 
 
 
115 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2663  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  50.43 
 
 
115 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2417  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  52.17 
 
 
115 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5355  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  49.57 
 
 
115 aa  119  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.922702  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0635  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  47.01 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379764  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43250  hypothetical protein  49.57 
 
 
115 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.708764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3630  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  49.57 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3305  hypothetical protein  48.7 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0278022  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2716  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  45.3 
 
 
115 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2588  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.07 
 
 
115 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3500  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.92 
 
 
115 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5991  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.15 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2056  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.44 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.240914  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3235  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  53.19 
 
 
101 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  44.44 
 
 
115 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2158  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.22 
 
 
116 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0585647  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3297  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  45.69 
 
 
122 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0612  hypothetical protein  53.49 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4549  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  41.03 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357845  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2807  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.94 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3374  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  47.41 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1704  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  37.84 
 
 
119 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2164  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.34 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2565  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  36.21 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4402  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.94 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2253  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.233801  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0419  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.34 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.820444  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3356  hypothetical protein  33.91 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217164  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3804  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.4 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3856  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.4 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1442  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.46 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03740  hypothetical protein  34.65 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1191  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.75 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4603  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.48 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0219  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.76 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.655327  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.45 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.189147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4837  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.09 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4872  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.45 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0248  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.76 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.286799  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2724  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.76 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1218  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.83 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1697  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.83 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1669  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.97 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1607  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.45 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5046  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.48 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.857324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4111  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.89 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000937447  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.67 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.61 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1478  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.83 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1372  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.76 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2193  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.23 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.08 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0947549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1500  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.87 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.033811  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32 
 
 
390 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4277  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.21 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06993  hypothetical protein  29.46 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1823  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.61 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.61 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304839 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000951  gfa-like protein  30.91 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1513  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.61 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1763  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.61 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0328446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2138  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.63 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3339  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.73 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.456035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1760  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.59 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.119906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5593  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.7 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.876476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4268  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0087  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0922  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.36 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3456  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.95 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0067  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.86 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1419  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.79 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.903205  hitchhiker  0.000000225635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0648  hypothetical protein  26.53 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9728  predicted protein  28.69 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0088  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.56 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1550  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.32 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0199849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0084  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.96 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2168  hypothetical protein  31.08 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.327259  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3597  hypothetical protein  27.18 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0840  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.08 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2758  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.21 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000797567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1551  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.93 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2117  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.18 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0449559  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2040  hypothetical protein  25.45 
 
 
144 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288241  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1962  hypothetical protein  25.45 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.45 
 
 
146 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>